أنشئت كلية العلوم في العام الجامعي 1996/1997م، وعند افتتاحها كان عدد البرامج أربعة برامج تمثل أربعة تخصصات في قسم الكيمياء، وقسم الفيزياء، وقسم الرياضيات، وقسم الأحياء، وبعد فترة تم افتتاح قسم الميكروبيولوجي.
وخلال السنوات الماضية حدثت نقلة نوعية في استحداث بعض الشعب لبعض الأقسام، مثل قسم الكيمياء حيث تم تشعيب الكيمياء الى ثلاث شعب هي: الكيمياء العامة، والكيمياء الحيوية، والكيمياء الصناعية، كما أن قسم الرياضيات حاسوب تم تشعيبه الى ثلاث شعب هي: حاسوب، ورياضيات حاسوب، ورياضيات. وتم تغيير وتطوير مقررات قسم الميكروبيولوجي ليتحول الى ميكروبيولوجي طبي.
وسعياً من أجل افتتاح اقسام جديدة فقد افتتح في العام الجامعي     /      م قسم الفيزياء التطبيقية بشعبتيه الطبية والصناعية من خلال توفير الدعم المالي اللازم له بالشراكة بين الجامعة والبنك الدولي لمدة      سنوات، ومن ثم تولت الجامعة الدعم المالي بشكل كامل.
كما افتتح في العام الجامعي      /       م قسم علوم الحاسوب وتقنية المعلومات ليواكب التطور العالمي في مجال الحاسوب والتقنية والمعلوماتية.
وفي مجال الدراسات العليا يوجد في الكلية برنامج الماجستير في الكيمياء في شعبه المختلفة، الكيمياء التحليلية، والكيمياء العضوية، والكيمياء الغير عضوية، والكيمياء الحيوية.
والعمل حالياً جاري ومستمر بوتيرة عالية من اجل افتتاح برامج الماجستير في بقية المساقات والأقسام والتخصصات الموجودة في الكلية.