تضم الوحدات الإدارية في عمادة شؤون المكتبات والتوثيق الإدارات العامة الآتية:
1- الإدارة العامة لشؤون عمادة المكتبات والتوثيق
2- الإدارة العامة للمكتبات
3- الإدارة العامة للتوثيق والتحقيق
وتضم كل إدارة العديد من الأقسام الفرعية، البعض منها فاعل والبعض منها قيد الدراسة والتحديث.